日本留学签证的停留期限根据具体情况有所不同，具体如下：

留学签证的有效期通常为6个月，但可以在日本国内进行更新，根据在读时间可以延期。持留学签证的在读时间最长为两年。

具体停留期限，例如，某签证的有效期是为3个月，停留期为1个月，那么从签证下发的那一天开始，任何一天都可以出入日本，但是从入境开始到出境，签证持有人在日本只能停留1个月。

另一种情况，如4-1-16签证，对象申读高等院校的自费留学生，这种学生在日本通常被称为正式留学生，获这种签证的居留期通常为1年、6个月或3个月。

对于就学生，即那些自费到日本留学，因语言纯熟程度不符合要求，不能直接升入各大学学习而先进入语言学校学习日语的外国学生，他们不是正式留学生。获这种签证的就学生，在日居留期限，通常只签半年。

综上所述，日本留学签证的停留期限可以从几个月到两年不等，具体取决于签证类型和个人的学习计划。建议根据个人实际情况和留学计划选择合适的签证类型，并提前了解签证的更新和延期流程。