办理日本留学手续主要包括以下几个步骤：

选择学校

确定目标学校，了解其入学要求、课程设置、学费等信息。

提交申请材料，包括个人简历、成绩单、推荐信等。

申请入学许可

向目标学校提交入学申请，并等待学校的录取通知。

一旦获得录取通知，学校会发放入学许可书。

申请在留资格认定证明书

通过学校向日本法务省入境管理局申请在留资格认定证明书。

提交必要的材料，如护照、照片、在留资格认定申请书等。

申请签证

持有在留资格认定证明书后，向日本驻外使领馆申请留学签证。

提交签证申请表格、在留资格认定证明书、护照、照片等材料。

缴纳学费和办理入学手续

在获得签证后，按照学校的通知缴纳学费和其他相关费用。

办理入学手续，如学生证、图书馆卡等。

到达日本并注册

按照学校的安排到达日本，并前往学校进行注册。

办理外国人登录证明等必要手续。

后续事项

根据学校规定，可能需要定期向入国管理局报告学习情况。

如有需要，可以申请延长居留期限或更改居留资格。

建议在申请过程中，提前了解并准备好所有必要的材料，确保申请过程顺利进行。同时，注意各个重要时间节点，以免错过申请机会。