选择留学日本的中介机构时，可以考虑以下几个因素：机构的经验、服务质量、专业咨询能力、用户评价以及是否提供一站式服务。以下是一些被广泛认为较好的中介机构：

新东方留学：

提供全面的留学规划和申请服务，包括语言培训、签证办理和生活适应指导。

启德教育：

拥有专业的咨询团队，能够根据个人情况量身定制留学方案，并在日本有广泛的合作关系。

华育留学：

专注于日本留学，提供专业的咨询顾问和贴心的服务，根据成绩、兴趣和职业规划推荐合适的大学。

金吉列留学：

提供一站式服务，包括语言培训、申请指导和签证办理。

芥末留学：

零中介费留学机构，以在线免费提供海外院校申请服务为特色，尤其在申请日本留学方面具有优势。

蔚蓝留学：

以零中介费申请为特色，专注于日韩留学业务，提供个性化的咨询服务和全面的支持。

前途出国：

凭借丰富的经验和专业的服务，赢得了众多留学申请者的信任，提供全面的留学规划。

新通留学：

以培训业务起家，如今在日本留学及语言培训方面表现稳健，尤其在杭州及南方市场具有较强的影响力。

学习谷：

虽然具体信息较少，但提到拥有多年经验的留学中介机构，通过与日本高校的合作，帮助学生成功申请到理想的学校。

樱花国际：

专注于亚洲留学市场，顾问团队对日本教育体系和文化有深入了解。

根据以上信息，可以根据个人的需求和偏好选择合适的留学中介机构。如果预算有限，可以考虑芥末留学等零中介费机构；如果需要全面的服务和专业的咨询，新东方留学、启德教育和新通留学都是不错的选择。此外，蔚蓝留学和前途出国在业内的口碑和用户评价也较高，值得考虑。