日本留学手机卡的办理流程如下：

选择手机运营商

日本主要的手机运营商有3家，分别是NTT的DOCOMO、KDDI的AU和SOFTBANK。留学生可以根据自己的需求选择合适的运营商。例如，DOCOMO在网络覆盖和信号稳定性方面较为出色，au则在提供优惠套餐和服务方面表现良好，而SoftBank则以提供国际漫游服务著称。

准备所需文件

办理手机卡需要携带一些必要的文件，包括护照、在留卡（居留卡）、学生证明、日本银行账户信息等。在办理过程中，工作人员可能会要求确认您的身份和留学生身份，因此务必携带这些文件前往办理。

前往手机店铺或在线申请

留学生可以选择前往手机运营商的实体店铺或者在官方网站上在线申请手机卡。如果选择前往店铺办理，工作人员会详细说明各种套餐和服务，并帮助您完成申请流程。如果选择在线申请，填写相关信息并上传所需文件即可。

激活手机卡并设置

一旦办理成功，留学生需要激活手机卡并进行相应设置。遵循手机卡说明书上的指引，将手机卡插入手机并按照提示完成激活和设置过程。在确认手机卡可以正常使用后，就可以开始享受日本当地的通讯和网络服务了。

关于合约机和预付费

办理合约机，一般来说就是和运营商签订长期合同，一般为期一年和两年。话费不是预充，而是每个月确定后再从银行卡或者信用卡里面扣掉。

其他注意事项

如果选择0元购机+套餐业务，需要签订两年合约，每月套餐费用大约为7000日元（约400元人民币），套餐包括无限时长通话和每月7-12G的流量包。如果中途解约，需要补齐手机剩余费用并缴纳违约金。

如果选择自带手机+格安卡套餐业务，可以免去买手机的环节，直接购买插入手机的SIM卡，价格相对便宜，适合只需要使用手机卡而不需要购买新手机的学生。

建议：

留学生可以根据自己的需求选择合适的运营商和套餐类型，提前准备好所需文件，选择合适的办理方式（实体店或在线申请），并在到达日本后及时激活手机卡并进行设置，以便尽快享受通讯服务。