去日本留学的缺点包括：

时间成本较高：

去日本留学读研最少需要2年时间，如果再加上读语言学校或研究生，则需要2.5-3年。与去英澳读一年硕士的费用差不多，但时间成本更高。

留学竞争逐渐加大：

近几年，选择赴日留学的人越来越多，导致留学申请竞争加剧，录取率逐年降低。

大部分日本大学学历认可度较低：

除了东京大学、京都大学等日本排名前30的大学外，其他大学的学历认可度较低，就业优势不明显。

语言和文化障碍：

日本的语言和文化与中国存在较大差异，留学生在适应过程中可能会遇到一定的困难，尤其是在口语和听力方面，需要付出更多的努力和时间进行学习和提高。此外，日本的社会文化习惯也与中国不同，留学生需要逐渐适应并融入当地社会。

生活成本较高：

虽然日本的留学费用相对较低，但生活成本却不容忽视，特别是在东京、大阪等大城市，住宿、饮食和交通等费用较高。留学生需要合理规划开支，以确保在经济上能够稳定地度过留学生活。

学术和就业竞争压力大：

日本的教育体系以严苛著称，留学生需要承受较大的学业压力。同时，日本劳动市场对外国留学生的开放程度有限，留学生在就业方面可能面临激烈的竞争。此外，由于日本社会对学历和专业的要求较高，留学生在选择专业和学校时需要谨慎考虑。

心理压力和孤独感：

留学生离开父母，需要独立解决生活中的各种问题，可能会感到孤独和压力。尤其是年龄较小、自控能力较差的学生，可能会受到错误价值观的影响，安全也成为家长担心的问题。

政治和自然灾害风险：

需要考虑政治形势的变化，尤其是中日关系的变化可能会对留学计划产生影响。此外，日本地震、火山等自然灾害频发，虽然日本社会对此有应对经验，但对留学生来说，这些因素仍然需要考虑。

签证办理和申请难度：

签证需要自行办理，过程较为繁琐。同时，由于日本留学竞争激烈，申请名校的难度较大，需要拼人品和运气。

生活节奏快，适应困难：

日本的生活节奏较快，留学生需要适应这种快节奏的生活，否则可能会感到压力和不适。

综上所述，去日本留学虽然有诸多优势，如文化体验、学术严谨等，但同时也存在不少挑战和困难。建议学生在选择留学目的地时，要全面考虑自身情况，做好充分的准备和规划。