日本留学的学费缴纳时间主要分两次，具体如下：

第一学期学费：

通常需要在4月份支付。

第二学期学费：

一般需要在9月份支付。

此外，有些情况下，学费可以分多次支付，例如：

公立大学可能会将下一学年的学费分三次付清。

建议提前了解并确认所在学校的具体缴费时间和方式，以确保按时缴纳学费，避免因延迟支付而产生不必要的麻烦。