日本留学申请的最佳时间通常有以下几种选择：

春季入学：

春季入学的申请截止日期一般在前一年的11月左右，因此申请准备工作需要在10月份之前完成。具体的申请时间可能因学校而异，建议提前了解并确认目标学校的具体申请截止日期。

秋季入学：

秋季入学的申请截止日期一般在前一年的4月左右，因此申请准备工作需要在3月份之前完成。具体的申请时间可能因学校而异，建议提前了解并确认目标学校的具体申请截止日期。

7月入学：

7月入学的申请截止日期通常在当年的5月左右，因此申请准备工作需要在4月份之前完成。这种入学时间的衔接较为紧凑，适合那些希望尽早入学的学生。

10月入学：

10月入学的申请截止日期通常在当年的8月左右，因此申请准备工作需要在7月份之前完成。这种入学时间适合那些在秋季入学前有更多准备时间的学生。

综上所述，日本留学的申请时间主要取决于学生选择的入学时间。建议学生提前了解并确认目标学校的具体申请截止日期，以便有足够的时间准备申请材料。