日本本科留学的申请材料包括以下几项：

入学申请书：

需要填写学校提供的固定格式表格，并签名盖章。

出身学校的调查表：

由出身学校提供，用于了解学生的背景信息。

最终学校的成绩书：

提供高中毕业证书和成绩单，以及大学入学考试成绩或语言能力测试成绩（如托福、雅思等）。

毕业（预定可以毕业）的书：

证明学生已注册并正常就读于该校。

毕业大学校长、学部长或指导教授的推荐信：

一般需要提供2-3封推荐信，推荐人可以是老师、导师或者工作单位的领导等。

健康诊断书：

证明学生身体健康，适合留学。

获得硕士学位（预定可以获得的）书：

如果已经获得硕士学位，需要提供相关证明。

外国人登录书（已在日本居留者）：

对于已经在日本居留的外国人，需要提供此证明。

照片：

提供近期免冠彩色证件照，具体尺寸要求请参考日本大使馆官网。

在毕业大学所作的研究论文及其要旨（概述）：

部分学校可能要求提供。

入学考试许可书（在其他的大学院学习或工作的人）：

如果已经在其他大学院学习或工作，需要提供此证明。

护照：

申请日本留学签证时必须提供的材料，需保持有效期在6个月以上。

在读证明：

提供目前所在学校的在读证明，证明学生已注册并正常就读于该校。

学历证明：

提供高中毕业证书和成绩单，以及大学入学考试成绩或语言能力测试成绩（如托福、雅思等）。

语言能力证书：

日本大学通常要求留学生具备一定的日语水平，需要提供日本语能力测试（JLPT）证书或J.TEST考试成绩单。对于非日语母语的学生，还需要提供英语能力证书，如托福、雅思等。

个人陈述：

这是一份介绍自己的文书，内容包括个人背景、兴趣爱好、学术成就、未来规划等。在日本本科申请中，个人陈述被认为是非常重要的一环，可以帮助招生官了解学生的个性和特长。

研究计划书：

部分日本大学会要求申请者提交研究计划书，详细阐述自己拟申请的专业领域以及未来的研究方向。研究计划书应该体现出申请人对所选专业的深入了解和独特的见解。

奖项证书：

如果曾获得过学术或艺术类奖项，可以在申请材料中予以体现，以增加录取竞争力。

资金存款证明：

日本留学签证的经济方面，对中国留学生有所放宽，很多情况不再需要提交资金的形成过程即流水，只需提交20万的资金存款证明即可。但是有几点大家要注意一下，开具证明的银行是大银行，以免不被认可。而且通常冻结时间一般为3-6个月。另外要注意在提交的时候冻结期限不要过期，否则也是无效的。

留学理由书：

日本留学理由书是日本入国管理局了解学生赴日留学动机的主要途径，因此理由书的撰写也很重要。书写时主要突出：为什么选择赴日本留学，在日本有什么留学规划，将来毕业后的选择去向等。

其他相关证明：

根据每个学校的要求，可能还需要提供其他相关的材料，如亲属关系表、誓约书、日本入境签证申请表等。

建议学生在准备申请材料时，仔细查阅目标大学的具体要求，并按照要求准备相应的文件和证明。