东京大学博士留学的费用主要包括学费和生活费两部分。具体费用如下：

学费

博士课程学费因专业不同而有所差异，但一般来说，每学年的学费在50万至100万日元之间。

具体到东京大学，博士课程的年度学费大约在535,800日元左右。

生活费

生活费包括住宿、餐饮、交通、娱乐等各个方面。根据个人生活习惯和消费水平的不同，生活费的数额也会有所差异。

一般来说，每月的生活费用大概在10万至20万日元之间。

住宿费用因地区和房屋类型的不同而有所差异，学生宿舍的月租金通常在2万至5万日元之间。

伙食费方面，自己做饭每月约3万日元，学校食堂一顿饭约600日元。

交通费用每月大约在5000至10000日元之间。

其他日常开销如购物、娱乐、学习资料等，每月预留5000至10000日元的预算是比较合理的。

其他费用

申请费用为30,000日元，还需支付银行转账的手续费和邮寄费用。

留学生健康保险和国民年金费用分别为20,000-25,000日元/年和16,590日元/年。

综合以上信息，东京大学博士留学的总费用（学费+生活费）大约在 150万至200万日元之间，具体费用还需结合个人情况而定。建议留学生提前规划好预算，并考虑申请奖学金和助学金以减轻经济压力。