去日本留学的签证费用及相关手续如下：

签证费用

签证费用为650元人民币。

签证签发手续费一次有效签证为人民币200元，多次有效签证为人民币400元。

延长居留期限

留学签证的居留期为一年，如超期继续学业，必须办理申请延长居留期的手续，此手续须在当地的入国管理局办理。

更改居留资格

需提交的材料包括再入国许可申请书、护照、外国人登录证、手续费（3000日元）。

签证类型及费用

学生签证费用为4,000日元。

短期留学签证费用为3,000日元。

其他类型签证（如留学预备签证、文化活动签证）费用各异。

代办费用

签证代办费用因留学中介而异，一些大型留学中介费用较高，而小型中介费用较亲民，建议多家比较选择性价比高的中介。

面试费用

面试费用约为20美元，若通过视频面试，可能需支付额外的网络使用费用。

其他相关费用

办理留学材料的费用（护照、签证、公证等）约为2000元人民币。

语言学校一年的学费在50~70万日元，硕士预科一年的学费在35万日元，硕士一年的学费在50~60万日元。

住宿费一年在30~60万日元，水电煤气费一年在12~25万日元，宽带费一年在8~15万日元，手机电话费一年在7~15万日元，吃饭一年在20~30万日元。

综上所述，去日本留学的签证费用及相关手续主要包括签证申请费650元人民币，多次有效签证费用400元人民币，延长居留期的手续费用，更改居留资格和再入国许可的费用，以及代办费用和面试费用等。建议提前准备好所有必需的材料，并根据自身情况选择合适的签证类型和留学中介。