日本留学申请的好地点主要包括以下几个：

东京

优势：东京是日本的首都和大城市，国际化程度高，拥有世界一流的大学和研究机构，如东京大学、早稻田大学等。东京的生活便利、现代化设施丰富，文化活动多样。

热门院校：东京大学、东京工业大学、筑波大学、早稻田大学、庆应义塾大学、一桥大学、上智大学、御茶水女子大学、东京医科齿科大学等。

京都

优势：京都是日本历史和文化的中心，拥有丰富的历史遗迹和优秀的大学，如京都大学、同志社大学等。京都的生活成本相对较低，环境优美，适合追求宁静生活的留学生。

热门院校：京都大学、同志社大学、立命馆大学、京都工艺纤维大学、京都府立大学等。

大阪

优势：大阪是日本第二大城市，经济中心，拥有众多优秀的大学和学院，如大阪大学、神户大学等。大阪的生活便利，地理位置优越，离名古屋、横滨都很近。

热门院校：大阪大学、神户大学、大阪市立大学、关西大学、关西学院大学、同志社大学、立命馆大学等。

关西地区

优势：关西地区包括大阪和京都，教育质量高，消费相对较低，留学性价比超高。许多大型公司在关西地区设有分公司，就业前景广阔。

热门院校：大阪大学、京都大学、神户大学、大阪市立大学、关西大学、关西学院大学、同志社大学、立命馆大学等。

东北地区

优势：东北地区包括北海道和东北地方，风景优美，有著名的北海道大学和东北大学。这里的雪景非常漂亮，吸引了很多学生。

热门院校：北海道大学、东北大学。

中部地区

优势：中部地区包括名古屋、信州大学、爱知县立大学等，交通便利，可以方便地去富士山游玩和东京。周边饮食、娱乐设施丰富，留学体验感高。

热门院校：名古屋大学、信州大学、爱知县立大学等。

福冈

优势：福冈是九州地区的城市，重要的港口和商业中心，气候温暖，生活活力四溢，有优秀的大学和学院。

热门院校：九州大学（虽未具体列出，但福冈有著名的大学）。

建议

东京：适合追求国际化环境和丰富学术资源的学生。

京都：适合希望深入研究日本文化、历史和艺术的学生。

大阪：适合希望在商业和经济领域发展的学生。

关西地区：适合希望在一个充满活力和创新精神的环境中学习的学生。

东北地区：适合喜欢自然美景和宁静生活的学生。

中部地区：适合希望交通便利、生活丰富的学生。

福冈：适合希望在温暖气候和丰富文化中学习的学生。

根据个人兴趣、职业规划和生活偏好，可以选择最适合自己的留学地点。